Правой кнопкой мыши кликаете по нужному торренту, в выпавшем окне выбираете "свойства", получаете такую картинку, где можно выставить нужные значения закачки или отдачи именно для этого торрента.
Похожая ситуация была и у меня, скорости вроде хватало, но браузер тормозил полностью при включенном торрент клиенте, оказалось, что во всём виноват модем, к которому были подключены все три моих компа, он не пропускал скорость, которую мне давал провайдер, после его замены на более модернизированный, всё наладилось и сейчас эта проблема пропала сама собой.