Здравствуйте.
Клиент-то как раз "знает". В некоторых версиях клиента µTorrent такие раздачи (на которых был заменен торрент-файл) даже выделяются красным цветом. В любом случае, в статусе анонсера трекера в графе "Трекеры" по таким раздачам будет значиться "Unregistered torrent".
Также можете в торрент-клиенте добавить дополнительный столбец в главном окне - "Состояние трекера". На раздачах с замененным торрент-файлом будет указано "Unregistered torrent", на корректно работающих раздачах - "Работает". "Проблемные" раздачи можно отсортировать щелчком мыши по этому столбцу - для удобства выявления раздач, на которых следует перекачать торрент-файл.
Заглянули в главное окно клиента - отсортировали раздачи по столбцу - и если увидели "Unregistered" - перекачали торрент из раздачи. Всего то и делов.
Автоматизировать эту процедуру - чтобы клиент сам перекачивал из раздачи торрент-файлы - с нашей стороны невозможно. К тому же, клиент не может "знать", почему статус трекера по торренту изменился - является ли это следствием замены торрент-файла в раздаче, либо удалением торрента с трекера вообще.