На древнерусском языке словом “мыт” называли официальное место сбора налогов и податей, аналогично современной таможне. Словом “кат”, как известно многим, называли палача, мучителя.
( отсюда ударение на первый слог кат

Источник: http://chtooznachaet.ru/vyrazhenie_n..._kataniem.html