Можно и так:
дважды нажимаем
BootExecute. Его значение заменяем на
autocheck autochk /k:C /k:D, где С и D это наши логические диски.
Это приведёт к отключению проверки указанных дисков.
А дабы отрубить проверку дисков при загрузке навсегда, просто удаляем
BootExecute.