А причем тут инструменты сторонних программ антивирусов? Я имею ввиду отключать доступ для группы "Все" на изменение и запись в корень флехи средствами самой винды. Если все сделано правильно, то у зловреда не будет возможности - ну не даст ему ФС - записаться в авторан.
Это вы к чему? newfishman же не пишет, что не может удалить малварь в новосозданной вирем "скрытой папке". Ему нужно предотвратить повторное попадание зловреда на флешку, а с нее и на другие машины, где флешка побывает.