И еще в добавку:
Для чего вообще по 18 фрагментов сохранять, а после склеивать? Это сколько мытарств.
Было бы намного проще, сразу, после открытия файла, больше не закрывая (пишу так, чтобы доходчиво было), отредактировать:
Удалить не нужные места - отметить начало и конец не нужных и удалить.
Если нужно местами менять, отметить начало и конец нужного места, Правка, вырезать, встать на нужное место и вставить, кусочек из памяти встанет за курсором. И т.д., принцип почти как на текстовых редакторах. В конце сохранить с нужными параметрами.
Да, тут конечно для точности нужно уметь применять "Умный рендеринг" или сохранять при полной обработки видео и звук лучше тоже....
Обязательно у обоих выставить и настроить нужные кодеки.