Как вариант - откатиться на более раннюю версию клиента... У меня Win7/64 + uT_2.0.2 - и без проблем. Вот ссылка:
uTorrent_2.0.2_Final_Rus.zip (можно и на 2.2.1 - тоже стабильная версия). Версия 3.1.2 в сочетании с Win7 иногда глючит! (прецеденты уже были не один раз)