Файл скачивается "кусочками" и не по порядку, а "вразброс". Когда у воспроизводимого файла отсутствуют начальные "кусочки", иногда и происходят наблюдавшиеся Вами "чудеса".
Поставьте в Настройках-> Дополнительно bt.prio_first_last_piece в true, тогда
самые первые и последние "кусочки" будут запрашиваться первыми.