Эти отличия не влияют на загрузку. Основное - место расположения ОС - прописано правильно. Есть предположение, что в компе периодически пропадает какой-то контакт в подключении жесткого диска. Цитата:
Обычная последовательность загрузки такая. После прохождения процедуры POST (Power On Self Test) начинает работу начальный загрузчик, который считывает главную загрузочную запись (MBR), которая находится в нулевом секторе диска, и определяет активный раздел, куда нужно передать команду загрузки. Видимо, загрузчик не имеет доступа к MBR, или MBR нарушена. Сначала нужно проверить надежность подключения проводов к жесткому диску, потом, если не помогло, загрузиться с загрузочного диска с виндой, выбрать не установку, а ремонт, и выполнить команду
FIXMBR. Загрузочная запись в нулевом секторе жесткого диска будет исправлена.