Отключения питания или внезапной перезагрузки в последнее время не было?
Если не внапряг и не поздно уже (то есть если уже и так все торренты не перезакачали), наберите, пожалуйста, в проводнике %APPDATA%\uTorrent и проверьте, нет ли там пропавших торрентов.
Если есть - открывайте и добавляйте так, как если бы скачали их заново.