Разберитесь с правами на запись и изменение файлов, как такового Администратора в Vista и Win7 нет, учетная запись отключена, попробуйте установить utorrent не в папку Program files, например c:/programs, измените папку загрузки по дефалту в utorrent для хранения .torrent файлов и самих загруженых файлов.
P.S. Win7 x86 + utorrent 2.0.* работают без проблем изменений никаких не вносил, единственное что сделал, установку запустил от имени администратора.