с чего вдруг они должны друг другу мешать работать?
в сони вегас насколько я знаю можно только в 448 кбит кодировать, в Sonic Foundry Soft Encode диапазон выбора битрейта намного шире.
и если вам просто нужно снизить битрейт у дороги, не заморачиваясь особо сильно, то это можно сделать и в XviD4PSP, хотя я сам предпочитаю использовать сторонние программы предназначенные для работы с аудио.